Inovar é um investimento em novas ideias e estratégias que irão agregar valor aos negócios. Pode ser aplicada em negócios de qualquer porte e está presente em todos os setores: comércio, serviço, agronegócio e indústria. Existem cinco possibilidades de inovação: de produto, com a inclusão de algo novo ou melhorado no mercado; de serviço, que parte do mesmo princípio da inovação de produto; de processo, quando o empresário passa a utilizar uma nova ferramenta de produção ou gestão; de marketing, ao aplicar novas formas de colocar em prática estratégias de concepção, apresentação e comercialização de um produto; e organizacional, que possui caráter gerencial, com foco em gestão de pessoas e otimização de produção.
O Sebrae incentiva a inovação entre as MPEs por meio do programa Faça Diferente, Inovar é um Ótimo Negócio. Trata-se de uma iniciativa aplicada de três formas: sensibilização, com o uso de palestras, seminários e workshops que irão fornecer informações sobre a importância do tema; capacitação por meio de cursos de gestão em estratégia, presencial ou a distância; e consultorias especializadas para implementação das ações.